17日，記者從浙江省農科院獲悉，該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與美國奧本大學、廈門大學合作，首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪製，為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產抗病優質良種提供了基因資源和技術手段，相關研究論文近日在線發表於學術期刊《分子生態學資源》上。
小黃魚是中國重要的海產經濟魚，味道鮮美，廣受青睞。2021年，浙江省農科院等單位通過連續8年產學研聯合攻關，突破了野生小黃魚馴活、人工催產和全人工規模化繁育關鍵技術，實現小黃魚網箱養殖規模化生產。隨著小黃魚全養殖產業的擴大和科研的深入，破譯小黃魚基因組，發掘生長、性別決定等相關重要功能基因成為擺在科研工作者麵前的重要課題。
全人工養殖的小黃魚 科研團隊供圖
“黃魚屬擁有東海四大海產中的小黃魚與大黃魚兩個重要經濟魚類，雖然它們形態和染色體核型相似，但是黃魚屬物種之間的遺傳關係尚未明確。”論文第一作者、浙江省農科院水生所助理研究員謝慶平博士介紹，本研究通過結合四類基因組測序技術，構建了小黃魚染色體水平的基因組精細圖譜；揭示小黃魚基因組大小為706 Mb，注釋基因為25233個；進化分析表明小黃魚與大黃魚親緣關係最近，大概在2540萬年前開始分化。
謝慶平介紹，魚類雌雄同體和雌雄異體的演化方向，在學術界仍然是一個有待解決的有趣謎團。此次研究通過轉錄組學、比較基因組學以及分子生物學的技術方法，鑒定出dmrt1基因為小黃魚的雄性特異性基因，且dmrt1基因序列的演化可以作為魚類中雌雄同體現象產生的生物標記。
論文通訊作者、浙江省農科院水生所所長樓寶研究員表示，小黃魚全基因組的解譯和基因組精細圖譜的繪製，對於海洋漁業資源保護、小黃魚養殖產業化以及分子遺傳育種技術的研究意義重大，可以為科研人員開展小黃魚種質資源挖掘保護、經濟性狀的遺傳解析和建立以基因組為基礎的輔助育種平台。
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作者: 科研人员首绘小黄鱼全基因组精细图谱******17日，记者从浙江省农科院获悉，该院水生生物研究所小黄鱼科研团队与美国奥本大学、厦门大学合作，首次完成小黄鱼全基因组组装注释与精细图谱绘制，为建立小黄鱼基因组选择育种、培育高产抗病优质良种提供了基因资源和技术手段，相关研究论文近日在线发表于学术期刊《分子生态学资源》上。
小黄鱼是中国重要的海产经济鱼，味道鲜美，广受青睐。2021年，浙江省农科院等单位通过连续8年产学研联合攻关，突破了野生小黄鱼驯活、人工催产和全人工规模化繁育关键技术，实现小黄鱼网箱养殖规模化生产。随着小黄鱼全养殖产业的扩大和科研的深入，破译小黄鱼基因组，发掘生长、性别决定等相关重要功能基因成为摆在科研工作者面前的重要课题。
全人工养殖的小黄鱼 科研团队供图
“黄鱼属拥有东海四大海产中的小黄鱼与大黄鱼两个重要经济鱼类，虽然它们形态和染色体核型相似，但是黄鱼属物种之间的遗传关系尚未明确。”论文第一作者、浙江省农科院水生所助理研究员谢庆平博士介绍，本研究通过结合四类基因组测序技术，构建了小黄鱼染色体水平的基因组精细图谱；揭示小黄鱼基因组大小为706 Mb，注释基因为25233个；进化分析表明小黄鱼与大黄鱼亲缘关系最近，大概在2540万年前开始分化。
谢庆平介绍，鱼类雌雄同体和雌雄异体的演化方向，在学术界仍然是一个有待解决的有趣谜团。此次研究通过转录组学、比较基因组学以及分子生物学的技术方法，鉴定出dmrt1基因为小黄鱼的雄性特异性基因，且dmrt1基因序列的演化可以作为鱼类中雌雄同体现象产生的生物标记。
论文通讯作者、浙江省农科院水生所所长楼宝研究员表示，小黄鱼全基因组的解译和基因组精细图谱的绘制，对于海洋渔业资源保护、小黄鱼养殖产业化以及分子遗传育种技术的研究意义重大，可以为科研人员开展小黄鱼种质资源挖掘保护、经济性状的遗传解析和建立以基因组为基础的辅助育种平台。
2024-05-21 22:49
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